Cálculos de orbital molecular desde cero con MOPAC, Avogadro y Jmol
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Interpretación de resultados de dinámica molecular
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Instalando diferentes versiones de Gromacs en el mismo ordenador
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UCSF Chimera UPDATED 2022. Installation and basic operation
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Docking peptido-proteina con ADFR suite
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23:03
Resolviendo errores comunes de Gromacs. Átomos OT1 y OT2 en cadenas múltiples de un archivo .pdb
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Tutorial de gromacs. Simulando una membrana con una proteína. Es aburrido pero se aprende Gromacs
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2:30:12
Padel Descriptor. Predictor de descriptores moleculares para modelos QSAR y demás.
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Calculando el coeficiente de tanimoto con LiSiCa
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8:52
Docking con metales pesados y otros átomos no parametrizados en Autodock
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29:17
El primer modelo QSAR, partir desde lo más sencillo con EasyQSAR.
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27:21
PyRx. Hacer Docking nunca fue tan fácil en Windows
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Docking fundamento teórico
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PoseView. Análisis de interacciones de complejos ligando receptor y generación de esquemas en 2D.
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10:18
Mi primer artículo con resultados 100% computacionales.
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Reactive Atom. Una herramienta sencilla para predecir el metabolismo de moléculas orgánicas.
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Aprende a usar Gromacs, tutorial para realizar una dinámica de una proteína en agua
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Tutorial. My first molecular dynamics with Gromacs, supported by Charmm-gui.
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Instalando Gromacs 2020.4 en Ubuntu, paso a paso.
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SOMP. Predicción del Sitio del Metabolismo con esta herramienta de Way2Drug
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VESTA. Instalación y primeros pasos de este software.
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Avogadro2. Instalando plugins para otros programas de química cuántica
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Docking flexible paso a paso con Autodock VINA
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Determinar el sitio de unión de una proteína y su potencial farmacológico con DogSiteScorer.
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MOPAC. Cálculos de química cuántica. Instalación y primeros pasos
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Analysis of docking with LigPlot. Installation and first steps.
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Crear un archivo con el complejo ligando-receptor resultante de docking
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Decifrando los archivos .pdb Parte I.
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Cribado virtual. Paso a paso usando VINA y Bash Scripting
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Separar moléculas de un solo archivo .sdf con una base de datos de moléculas.
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Virtual Screening using Raccoon and Autodock. Tutorial from scratch.
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PASS online. Conoce qué actividad biológica tiene tu compuesto en menos de 5 minutos.
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Re-Docking. Validación de ensayos de Docking.
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Pymol. Installation and first steps.
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XenoSite. Predicción rápida del metabolismo
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¿Qué son los modelos QSAR?
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¿Qué es el código SMILES? y ¿Cómo lo podemos obtener?
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Open Babel instalación y primeros pasos en linux. Convertir moléculas de un formato a otro.
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Tutorial. Molecular docking with VINA, using Autodock Tools.
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Docking desde cero. Tutorial AutodockTools.
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¿Cómo seleccionar el mejor modelo del PDB para estudios de docking, dinámica o 3D QSAR?.
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Performing Molecular Docking with Autodock Vina, via UCSF Chimera
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UCSF Chimera. Instalación y primeros pasos
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Installing Autodock Tools and Autodock Vina on Ubuntu Linux. 2020
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