Discovery Studio : Comment visualiser les interactions entre une protéine et un ligand

Dans cette vidéo, nous montrons comment utiliser Discovery Studio pour explorer les interactions entre une protéine et un ligand, en mettant en évidence les liaisons hydrogène et les interactions hydrophobes.

Étapes :

1. Télécharger et installer Discovery Studio : Rendez-vous sur le site de Dassault Systèmes pour télécharger gratuitement Discovery Studio pour Windows ou Linux.
2. Ouvrir Discovery Studio : Lancez le logiciel une fois l'installation terminée.
3. Importer la protéine cible et le ligand : Chargez les fichiers de votre protéine et de votre ligand dans le logiciel.
4. Suivre les étapes du tutoriel : Suivez notre guide détaillé pour visualiser les interactions protéine-ligand.
5. Exporter votre image : Sauvegardez votre visualisation sous le format de votre choix (nous recommandons le format SVG).

Interactions visualisées :

Liaisons hydrogène (3) : ASN 209, THR 206, ARG 116
Interactions Pi-Anion et Pi-Cation (4) : ASP 218, ASP 208, LYS 73, LYS 50
Interactions Pi-Pi en forme de T (3) : ILE 37, PHE 35, LYS 50
Interaction défavorable (1) : ASN 52

Apprendre à utiliser Discovery Studio vous permet d'analyser les interactions cruciales entre les protéines et les ligands.